Když odinstalujete produkt Rational Publishing Engine, nejsou odebrány složky pracovního prostoru, poněvadž jsou všechna nastavení zachována pro opětovné použití při přeinstalování stejné verze.
Pokud používáte produkt Rational Tau jako zdroj dat, ručně odinstalujte doplněk Rational Tau na systému Linux odstraněním složky %TAU_HOME%/addins/RPE.