A Tisztítás művelet egyedülálló Java fájlon vagy több projekten hajtható végre, a Java elemek kijelölésével és a Forrás > Tisztítás... parancs végrehajtásával
A Tisztítás kódstílus norma kényszerítését teszi lehetővé több fájlra vagy egész projektre. Lehetővé teszi továbbá gyorsjavítások kötegelt alkalmazását figyelmeztetések, potenciális programozási problémák, illetve szükségtelen vagy használaton kívüli kódok eltávolítására.
A tisztítási beállítások Tisztítási profilokban kerülnek tárolásra. Minden projekt megadhatja az alapértelmezett profilt, ami akkor kerül alkalmazásra, amikor a projekt valamelyik fájlján a Tisztítási műveletet meghívják. Ha a projekt nem ad meg profilt, akkor a munkaterület alapértelmezett profilja kerül alkalmazásra.