Rydd opp-handlingen kan utføres på en enkelt Java-fil, en Java-pakke, et Java-prosjekt eller på flere prosjekter ved å velge Java-elementene og velge Kilde > Rydd opp...
Handlingen Rydd opp gjør det mulig å bruke en standard kodestil på flere filer eller et helt prosjekt. Det gjør det også mulig å ta i bruk hurtigrettelser satsvist for å fjerne advarsler, potensielle programmeringsproblemer, og unødvendig eller ubrukt kode.
Innstillingene for opprydding blir lagret i oppryddingsprofiler. Hvert enkelt prosjekt kan definere standardprofilen som skal brukes når Rydd opp blir startet fra en av prosjektets filer. Hvis et prosjekt ikke oppgir noen profil, brukes arbeidsområdets standardprofil.