As seguintes preferências podem ser alteradas na página
Executar/Depurar > Ferramentas Externas
.
É possível configurar se você será ou não avisado antes da migração dos construtores de projetos de ferramentas externas.

Página de Preferências do Ant
Página de Preferências do Tempo de Execução do Ant
Página de Preferências do Editor de Ant